Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Slc28a3Q9ERH8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms