Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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