Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms