Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms