Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Tmco5aQ9D9D5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmco5aQ9D9D5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmco5aQ9D9D5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tmco5aQ9D9D5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmco5aQ9D9D5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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