Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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