Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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