Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms