Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms