Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc7Q9D541 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc7Q9D541 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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