Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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