Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc83Q9D4V3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc83Q9D4V3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc83Q9D4V3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms