Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lonrf3Q9D4H7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lonrf3Q9D4H7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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