Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UvssaQ9D479 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms