Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms