Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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