Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms