Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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