Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Shmt2Q9CZN7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms