Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms