Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Tmed5Q9CXE7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmed5Q9CXE7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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