Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms