Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn3Q9CVD2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Atxn3Q9CVD2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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