Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms