Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms