Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Nicn1Q9CQM0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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