Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms