Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms