Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms