Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpa3Q9CQ71 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpa3Q9CQ71 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms