Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Use1Q9CQ56 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms