Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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