Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms