Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms