Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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