Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3Q99NH2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms