Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms