Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NsmfQ99NF2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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NsmfQ99NF2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NsmfQ99NF2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NsmfQ99NF2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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NsmfQ99NF2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms