Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hdac9Q99N13 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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