Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms