Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RtcbQ99LF4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms