Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp11Q99K46 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp11Q99K46 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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