Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms