Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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