Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

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Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Creb3l3Q91XE9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Creb3l3Q91XE9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms