Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Sh3bgrl3Q91VW3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Sh3bgrl3Q91VW3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 652.4 ms