Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms