Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cabp4Q8VHC5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cabp4Q8VHC5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms