Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms1Q8VCQ6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms