Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms